超聲波清洗機清洗槽的水里往往需要加入清洗劑，清洗劑的選擇，一方面要根據污物種類選擇針對性的清洗劑，另一方面，需要考慮清洗劑對水造成的表面張力和粘滯度等性質的改變，因為這些性質都與空化強度有關。液體表面張力越大，空化難度越大。就像要撕開一張薄膜和一張牛皮，張力越大，需要的力度就越大。同時液體粘滯度大，也不容易產生空化。所以，應當選擇粘滯度小的清洗劑。
超聲波在傳播過程中，如果遇到水中的氣泡（不是空化泡），它的傳播就會收到影響，導致空化泡產生收到影響。另外，生成的空化泡如果擴散到空氣泡中，在爆破的時候會降低它產生的沖擊力度，影響清洗效果。因此，超聲波清洗機在使用之前，應當排除水中的氣泡。
頻率是選擇超聲波清洗機的一大因素，頻率也決定了清洗力度。一般的來講，清洗五金、機械、汽摩、壓縮機等行業的清洗多采用28KHZ頻率的清洗機。光學光電子清洗、線路板清洗等多采用40KHZ的頻率。事實上空化效應的強度直接跟頻率有關，頻率越高，空化氣泡越小，空化強度越弱。而且高頻穿透力強，適合清洗精密零件，比如電子零件、磁性材料、小型軸承加工;那些集成電路芯片、硅片鍍膜的則用更高的頻率超聲波清洗機;像那些機動車輛的發動機、閥門等大工件一般則用低頻率超聲波清洗機清洗，而市場用的比較適中的頻率是40KHZ。
超聲波清洗在清洗過程中起著輔助作用，主要的除油、除蠟、除脂是通過清洗劑的化學作用去除的。所以要想清洗效果好，必須明確污垢類型，要是所選用的清洗劑不與污垢產生化學作用，再怎么努力也是徒勞。
超聲波清洗機清洗四個主要參數：換能器頻率（工件大小決定）、超聲波清洗機系統（水基清洗劑/溶劑）、功率密度、清洗溫度。還有零件的擺放位置等都會影響到效果，只有選擇適合的參數，才能達到清洗效果，設定好參數后，一般清洗3-5min即可達到滿意的清洗效果，一般不超過10min。
超聲波清洗的效果是顯而易見的，在開啟高頻超聲的一瞬間，不規則器件表面和空腔內的污垢自動清除，形成大量的煙霧狀發散。當然在選擇機器上有著嚴格的標準，比如小龍蝦或螃蟹牡蠣等水產品，可以利用微彌中頻超聲，清洗眼鏡鉆戒，可以利用微彌高頻超聲等等，具體內容還可以請教專業技術人員。
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